Mitmed USA föderaalagentuurid on algatanud uurimused Morgan Stanley suhtes kliendikontrollide osas rahapesuriskide tuvastamiseks. Lisaks Väärtpaberite ja Börsikomisjonile (SEC) ja Valuutakontrolleri Ametile (OCC) on uurimistesse kaasatud ka teisi Rahandusministeeriumi osakondi. Peamine tähelepanu on suunatud sellele, kas Morgan Stanley kontrollib piisavalt potentsiaalsete klientide isikusamasusi ja nende varade päritolu ning jälgib nende finantstegevust. Eriti luubi all on panga rahvusvahelised kliendid.

Federal Reserve, mis juba novembris The Wall Street Journali poolt uurimiste raames mainiti, on pangale vihjanud, et kaalutakse järelevalvemeetmeid. Morgan Stanley töötab selle nimel, et lahendada reguleerivate asutuste poolt tõstatatud probleeme. Endine tegevjuht ja praegune täidesaatev esimees James Gorman rõhutas, et investeeritakse järgimisse, tehnoloogiasse ja tehisintellekti, et paremini mõista varahalduseäris seotud rahavooge.

Pärast teateid laiendatud uuringute kohta langes Morgan Stanley aktsia üle 5% kolmapäeva pärastlõunases kauplemises. SEC esitas pangale nimekirja praegustest ja endistest klientidest, et uurida, kuidas neid kontrolliti. Samuti küsiti, miks panga varahaldusüksus tegi tehinguid mõnede klientidega, keda Morgan Stanley enda digitaalne kauplemisplatvorm E*Trade turvariskide tõttu välistas.

Rahandusministeeriumi Financial Crimes Enforcement Network (FinCEN) ja välismaiste varade kontrolli büroo (OFAC) on samuti Morgan Stanleyle infot nõudnud. OCC teavitas panga kliendiülevaatuste põhjal "tähelepanu vajavast asjaolust". See järgnes panga rahapesu tõkestamise programmi aastasele ülevaatusele.

Morgan Stanley varahaldusüksus on alates 2008-09 finantskriisist ettevõtte strateegia keskne osa. Divisjon, mis moodustab umbes poole ettevõtte kogutuludest, on hiljuti näidanud aeglustumise märke, neljanda kvartali müügitulu ei muutunud võrreldes eelmise aastaga.