गुरुवार को, तकनीकी खराबी के कारण संपूर्ण जर्मन हवाई क्षेत्र में डॉयचे फ्लुग्सीशरुंग (जर्मन एविएशन सेफ्टी) को महत्वपूर्ण विलंब और रद्दीकरण का सामना करना पड़ा। फ्रैंकफर्ट का सबसे बड़ा जर्मन हवाई अड्डा विशेष रूप से प्रभावित हुआ, जहां शुक्रवार दोपहर तक लगभग 100 उड़ानें रद्द कर दी गईं। बर्लिन, डसेलडोर्फ और स्टटगार्ट भी उस खराबी के प्रभावों से प्रभावित हुए, जो सुबह 9.00 बजे के आसपास शुरू हुई।

रुकावट का कारण उड़ान योजना डेटा और मौसम जानकारी में खराबी थी, जिसके कारण देशभर में विभिन्न देरी हुई। यद्यपि सिस्टम सुबह 10:25 बजे से फिर से चल रहे हैं, लेकिन शुक्रवार को यात्रियों पर इसका प्रभाव अभी भी महसूस किया जा रहा है। फ्रापोर्ट, जो फ्रैंकफर्ट हवाई अड्डे का परिचालन करता है, ने बताया कि 1,300 से अधिक उड़ानें और लैंडिंग योजनाबद्ध हैं, लेकिन अभी भी देरी और संभावित उड़ान रद्द होने की संभावना है। फ्रापोर्ट के एक प्रवक्ता ने यात्रियों को सलाह दी कि वे नियमित रूप से ऑनलाइन अपनी उड़ान की स्थिति की जांच करें और हवाई अड्डे पर पहुंचने का समय उसी के अनुसार समायोजित करें।

लुफ़्थांसा ने भी कुछ उड़ानों के रद्द होने और देरी की पुष्टि की, लेकिन जोर देकर कहा कि लंबी दूरी की उड़ानें अब तक अप्रभावित रही हैं। हालांकि, एयरलाइन को उम्मीद है कि इसके प्रभाव शुक्रवार तक महसूस किए जा सकते हैं। बर्लिन हवाई अड्डे पर विशेष रूप से दोपहर के समय अधिकतम एक घंटे की देरी हुई, जिसमें म्यूनिख और फ्रैंकफर्ट के लिए कुछ उड़ानें रद्द कर दी गईं।

बवेरियन राज्य सरकार ने उत्पन्न हुई समस्याओं के समाधान के लिए त्वरित उपायों की मांग की। मेयर डाइटर राइटर (एसपीडी) ने म्यूनिख हवाई अड्डे की वर्तमान प्रदर्शन से असंतोष व्यक्त किया और सभी पक्षों से समस्या को तुंरत हल करने की अपील की। हवाई अड्डे ने स्वयं देर दोपहर को एक सूचना बैठक का आयोजन किया, जिसमें फ्रापोर्ट, लुफ्थांसा और सुरक्षा कंपनी एसजीएम के प्रतिनिधियों को अल्पकालिक उपायों के बारे में जानकारी देनी थी।

अत्यावश्यक बाधा के बावजूद, ऊपरी बवेरिया की सरकार जोर देती है कि कोई स्टाफ की कमी नहीं है। कुल मिलाकर, हवाई अड्डे पर 62 नियंत्रण रेखाएँ काम कर रही थीं, और क्षमता बढ़ाने के लिए दो अन्य रेखाओं का आधुनिकीकरण किया गया था। फिर भी, डीजीबी बवेरिया जैसी यूनियनों ने उन कार्य स्थितियों की आलोचना की, जो असहनीय स्थितियों में योगदान करती हैं।

गुरुवार को, एक ही समय में बड़ी संख्या में यात्रियों के आगमन के कारण सुरक्षा जांच में अत्यधिक भीड़ हो गई, जिससे लंबे इंतजार और अत्यधिक कतारें लगीं। विशेष रूप से लुफ्थांसा द्वारा उपयोग किए जाने वाले टर्मिनल 2 प्रभावित हुआ, क्योंकि कई यात्री अपनी फ्लाइट से काफी पहले हवाई अड्डे पर पहुंच गए थे।